Thomas y sus amigos descansan después de escapar del laberinto, sintiendo que ya pueden estar a salvo de los peligros. No obstante, unos gritos perturbadores los despiertan una noche, teniendo que enfrentarse a una realidad todavía más aterradora que la anterior.
El nuevo mundo es cada vez más peligroso, un teeritorio estepario en el que se ven perseguidos y amenazados por seres contaminados, a los que llaman "los raros". Tampoco pueden confiar en los adultos, hambrientos y delirantes, que los persiguen y acechan por ese mundo apocalíptico.
En esta nueva aventura de supervivencia, Thomas no sólo debe descubrir todo su pasado, sino saber en quién debe confiar para seguir adelante.
Es la segunda historia de la trilogía El corredor del laberinto, inspirada en los libros de James Dashner. El primer libro, llevado al cine en 2014, tiene como protagonista a Dylan O’Brien.